Skip to content

marvin2024_A

filips edited this page Nov 26, 2024 · 4 revisions

Wstęp

💡 Proszę przeczytać dokładnie poniższe instrukcje.

  1. Pobieramy dokument - template do odpowiedzi
  2. Sprawdzamy strukturę, która została nam przydzielona (w formacie SMILES)
  3. Wypełniamy tabelę w nagłówku dokumentu odpowiedzi
  4. Odpowiadamy na pytania.
  5. Odpowiedzi wysyłamy na mój adres (do znalezienia tutaj)

Uwagi:

  • typowe wartości pH w różnych obszarach przewodu pokarmowego pokazane są na rysunku na dole tej strony; proszę przyjąć dolne wartości zakresów.
  • po wysłaniu arkusza odpowiedzi (i upewnieniu się, że mail wyszedł z załącznikiem) należy skasować wszystkie pliki związane z kolokwium z komputera (tj pulpitu, pobranych itp)
  • Wykonanie zrzutu ekranu: Ctrl+PrtScr

Życzę powodzenia! 👍

Zadanie 1

Dla wskazanej cząsteczki proszę wyznaczyć:

  1. pKa wszystkich grup których to może dotyczyć (załączyć rysunek); dołączyć odpowiedni wykres udziału poszczególnych form w zależności od pH
  2. Czy związek ma szansę wchłaniać się w jamie ustnej, żołądku, jelitach? Odpowiedź krótko uzasadnić (1-2 zdania).
  3. Dla wartości pH typowych dla śliny, żołądka, jelita proszę policzyć logD w tych pH; podać wartości oraz załączyć odpowiednie wizualizacje
  4. Policzyć PSA (polar surface area 2D) i podać jego wartość

Zadanie 2

Dla wskazanej cząsteczki stwierdzono, iż pewne efekty niepożądane związane są z terminalną grupą aromatyczną. Na podstawie bazy bioizosterów proszę zaproponować zamianę tej grupy na inną, która nie spowoduje zwiększenia masy molowej ani logP.

  • Proszę załączyć zrzut ekranu odpowiedniego wpisu w bazie danych
  • Przewidywania potwierdzić obliczeniami w programie Marvin - proszę podać MW i logP oryginalnego i zmodyfikowanego związku.

pH

(Za: Review of in vitro digestion models for rapid screening of emulsion-based systems, David Julian McClements and Yan Lia, Food Funct., 2010,1, 32-59)

Clone this wiki locally