krotki_kurs

Wprowadzenie

• krótki wykład nt. drogi od pomysłu do leku

Skąd brać informacje o związkach aktywnych?

• google patents: http://www.google.com/patents
• zarejestrowane leki: http://www.drugbank.ca/
• aktywność małych cząsteczek: https://www.ebi.ac.uk/chembl/

Jak analizować dane?

• KNIME - https://www.knime.com/

Instalacja dodatków: File -> Install knime extensions

• KNIME community contributions - cheminformatics
• Marvin chemistry extensions

Jak przewidzieć oddziaływania?

• baza danych PDB (Protein Data Bank): https://www.rcsb.org/
• docking: http://www.swissdock.ch/docking

projektowanie "własnych" ligandów

• wstęp: https://filipspl.github.io/CADD-PW/fiz-chem.html#/