koronawyklad2

Jump to bottom

filips edited this page Oct 13, 2020 · 5 revisions

🦠 Koronawykład #2 (online)

Zasoby ogólne
Zasoby danych dot. celów molekularnych

Literatura

Pubmed: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
Google scholar: https://scholar.google.pl/

Patenty

google patents: https://www.google.com/patents

Cele molekularne / choroby

https://www.targetvalidation.org/ - brings together information on the relationships between potential drug targets and diseases

Sekwencje

Wstęp
https://www.uniprot.org/ high-quality and freely accessible resource of protein sequence and functional information.

Szukanie podobnych sekwencji

BLAST - Basic Local Alignment Search Tool Patrz: wikipedia
Psi BLAST: Serwer NCBI | Serwer EBI | Serwer MPG
Smart BLAST: Serwer NCBI
NCBI BLAST Serwer EBI - to find regions of sequence similarity, which will yield functional and evolutionary clues about the structure and function of your novel sequence.
HHPRED - Homology detection & structure prediction by HMM-HMM comparison ⚠️ WOLNE

Alignment

Dopasowanie sekwencji, uliniowienie sekwencji: wikipedia
https://www.ebi.ac.uk/Tools/psa/emboss_needle/ - Dwie sekwencje (Pairwise)
http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/ - Multiple Sequence Alignment

💡 Więcej informacji i zasobów

Computer Aided Drug Design @ Politechnika Warszawska, Filip Stefaniak