marvin2023_A

💡 Ogłoszenie

Zamiast ostatnich zajęć 24 stycznia proponuję wykład on-line w TYM tygodniu (czwartek lub piątek).

Sprawdzian

💡 Proszę przeczytać dokładnie poniższe instrukcje.

Wstęp

1. Pobieramy dokument - template do odpowiedzi
2. Sprawdzamy strukturę, która została nam przydzielona (w formacie SMILES)
3. Wypełniamy tabelę w nagłówku dokumentu odpowiedzi
4. Odpowiadamy na pytania.
5. Odpowiedzi wysyłamy na mój adres (do znalezienia tutaj)

• typowe wartości pH w różnych obszarach przewodu pokarmowego pokazane są na rysunku na dole tej strony; proszę przyjąć dolne wartości zakresów.
• po wysłaniu arkusza odpowiedzi (i upewnieniu się, że mail wyszedł z załącznikiem) należy skasować wszystkie pliki związane z kolokwium z komputera (tj pulpitu, pobranych itp)
• Wykonanie zrzutu ekranu: Ctrl+PrtScr

Życzę powodzenia! 👍

Zadania

Dla wskazanej cząsteczki proszę wyznaczyć:

1. pKa wszystkich grup których to może dotyczyć (załączyć rysunek); dołączyć odpowiedni wykres udziału poszczególnych form w zależności od pH
2. Czy związek ma szansę wchłaniać się w jamie ustnej, żołądku, jelitach? Odpowiedź krótko uzasadnić (1-2 zdania).
3. Dla wartości pH typowych dla śliny, żołądka, jelita proszę:
   1. Policzyć logD w tych pH; podać wartości oraz załączyć odpowiednie wizualizacje
4. Policzyć PSA (polar surface area 2D)
5. Policzyć rozpuszczalność w wodzie:
   1. pokazać wykres zależności rozpuszczalności (w mg/ml!) od pH
   2. ile wynosi rozpuszczalność (mg/ml!) w pH śliny, żołądka, jelita?
6. Wyznaczyć kilka niskoenergetycznych konformerów cząsteczki i zapisać w formacie sdf.

---

(Za: Review of in vitro digestion models for rapid screening of emulsion-based systems, David Julian McClements and Yan Lia, Food Funct., 2010,1, 32-59)