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Shan9Ye/Molecular-Dynamics-Simulation

 
 

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《分子动力学模拟入门》书稿与源代码

这是一项正在进行的工作。本仓库将公开书稿内容和源代码(每一章的文件夹中有 PDF 形式的书稿和 C++ 等源代码),欢迎读者指正。当前进度:

  • 第0章:物理基础(已经完成)。
  • 第1章:一个简单的分子动力学模拟程序(已经完成)。
  • 第2章:模拟盒子;近邻列表(已经完成)。
  • 第3章:预计写多体势函数,重点是 EAM 和 Tersoff(在写)
  • 第4章:预计写控温算法、控压算法及一些平衡态性质的计算
  • 第5章:预计写时间关联函数、扩散系数、热导率等输运性质的计算
  • 第6章:预计写CUDA 加速、NEP 机器学习势、结合 GPUMD 介绍一些应用

讨论群

  • 读者可加入作者的 QQ 群: 887975816。
  • 该群主要讨论分子动力学模拟中的算法和作者开发的 GPUMD 程序 (https://gpumd.zheyongfan.org) 的使用。

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Sample codes for my book on molecular dynamics simulation

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