diff --git a/doc/workflow.drawio.svg b/doc/workflow.drawio.svg index 8bbab0a..2000bfa 100644 --- a/doc/workflow.drawio.svg +++ b/doc/workflow.drawio.svg @@ -1,4 +1,4 @@ - + @@ -32,9 +32,9 @@ - - - + + + @@ -57,14 +57,14 @@ - + - + -
+
FASTQ (Reads) @@ -72,31 +72,31 @@
- + FASTQ (Reads) - + - + S. Pneumo:     ≥ 60% - + Other Genus:  ≤ 2% - + - + Contigs:  ≤ 500 - + Length:   1.9 - 2.3 Mb - + Depth:     ≥ 20x @@ -104,7 +104,7 @@ -
+
FASTA (Assemblies) @@ -112,7 +112,7 @@
- + FASTA (Assemblies) @@ -121,7 +121,7 @@ -
+
SAM @@ -129,17 +129,17 @@
- + SAM - + - + Ref Coverage: ≥ 60% - + Het-SNP site:  ≤ 220 @@ -147,7 +147,7 @@ -
+
Results @@ -155,17 +155,17 @@
- + Results - - - - - - + + + + + + @@ -282,7 +282,7 @@ - + @@ -305,7 +305,7 @@ - + @@ -327,7 +327,7 @@ - + @@ -349,8 +349,8 @@ - - + + @@ -370,7 +370,7 @@ - + @@ -392,7 +392,7 @@ - + @@ -414,7 +414,7 @@ - + @@ -436,13 +436,13 @@ - + Bases: ≥ 38 Mb - +