agro-bio/.gitignore at main · engineer-antonio/agro-bio · GitHub

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
# ============================================================================
# 🧬 ARABIDOPSIS THALIANA GENE ANALYSIS - Projeto de Bioinformática
# ============================================================================
#
# DESCRIÇÃO DO PROJETO:
# Ferramenta interativa para análise de sequências genômicas do Arabidopsis
# thaliana com visualizações, estatísticas avançadas e modelos de Machine Learning.
#
# FUNCIONALIDADES PRINCIPAIS:
# 1. Análise Exploratória - Estatísticas e distribuições de sequências
# 2. Análise de Nucleotídeos - Contagem A, T, C, G com heatmaps e box plots
# 3. Machine Learning - Classificação com Random Forest e feature importance
# 4. Comparação de Sequências - Correlações, scatter plots e análises comparativas
#
# STACK TECNOLÓGICO:
# - Python 3.13 - Linguagem de programação
# - Streamlit - Framework web interativo
# - Biopython - Bioinformática e processamento de sequências FASTA
# - Pandas - Manipulação e análise de dados
# - NumPy - Computação numérica e arrays
# - Matplotlib - Visualização de gráficos
# - Seaborn - Gráficos estatísticos avançados
# - Scikit-learn - Machine Learning (Random Forest, métricas, normalização)
#
# DADOS UTILIZADOS:
# - Arabidopsis_thaliana.TAIR10.dna.chromosome.1.fa - Sequência genética do cromossomo 1
#
# ============================================================================

# ============================================================================
# AMBIENTE VIRTUAL E DEPENDÊNCIAS
# ============================================================================
# Python virtual environment
.venv
venv/
ENV/
env/
.env

# Arquivos de cache do pip
pip-log.txt
pip-delete-this-directory.txt

# Distribuições do pacote
*.egg-info/
dist/
build/

# ============================================================================
# CACHE DO PYTHON E COMPILAÇÃO
# ============================================================================
__pycache__/
*.py[cod]
*$py.class
*.so
.Python

# Pytest e testes
.pytest_cache/
.coverage
htmlcov/

# ============================================================================
# IDE E EDITOR
# ============================================================================
.vscode/
.idea/
*.swp
*.swo
*~
.DS_Store

# ============================================================================
# CACHE DO STREAMLIT
# ============================================================================
# Streamlit mantém cache de dados a-priori
.streamlit/
streamlit_cache/

# ============================================================================
# ARTEFATOS DE EXECUÇÃO
# ============================================================================
# Arquivos gerados durante a análise
*.tmp
*.cache
*.log