@@ -33,6 +33,7 @@ Para obtener MAGs podemos seguir el siguiente flujo de análisis:
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<img src =" {{ page.root }}/fig/extrasMAGs/01.MAGs_workflow.png " alt =" Flujo de trabajo para Metagenómica Centrada en Genomas " />
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</a >
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+ <br >
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Ya que discutimos como seguir un flujo de análisis para reconstruir genomas entremos en acción, para ello analizaremos el metagenoma del pozol.
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@@ -45,6 +46,7 @@ se consume desde tiempos prehispánicos y se ha estudiado desde los años 50s.
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<img src =" {{ page.root }}/fig/extrasMAGs/02.Pozolhistoria.png " alt =" Proceso de elaboración del pozol " />
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</a >
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+ <br >
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Algunos puntos importantes que conocemos son:
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<FONT COLOR =" darkblue " >
@@ -62,22 +64,19 @@ Algunos puntos importantes que conocemos son:
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🧬🔊🦠 Imaginemos que se quiere impulsar la producción de esta bebida y para ello necesitan saber todo acerca de su naturaleza microbiana.
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Una importante industria alimenticia los contacta como ` expertos en ecología microbiana ` y les pide ayuda para descubrir los siguientes puntos:
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-
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+ < br >
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<FONT COLOR =" darkblue " >
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* ¿Qué actores microbianos están presentes durante el proceso de fermentación?<br >
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- </FONT >
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- <FONT COLOR =" darkblue " >
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* ¿Cómo ocurre la bioconversión del maíz durante la fermentación, quién participa y cómo lo hace? ¿Qué funciones metabólicas están ocurriendo?<br >
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- </FONT >
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- <FONT COLOR =" darkblue " >
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* ¿Cambia la comunidad microbiana a lo largo del proceso?<br >
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</FONT > <br >
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La empresa secuenció cuatro puntos de fermentación de muestras que se obtuvieron en un mercado de Tabasco.
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Las muestras se secuenciaron con Illumina NextSeq500 con lecturas pareadas de 75 pb.
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Los datos están públicos bajo el Bioproject: [ PRJNA648868] ( https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA648868 )
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+ <br >
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<a href =" {{ page.root }}/fig/extrasMAGs/03.Pozol_fermentation.png " >
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<img src =" {{ page.root }}/fig/extrasMAGs/03.Pozol_fermentation.png " alt =" Puntos de fermentación " />
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</a >
@@ -134,6 +133,8 @@ Cómo vamos a trabajar durante el taller?
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{: .callout}
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+ ------------------------------------------------------------------------
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