BioCondaのosx-arm64サポートについて

[akikuno]

As Is（今の状態を記載）

osx-arm64を用いたBioConda経由のインストールには以下のような工夫が必要でした。

CONDA_SUBDIR=osx-64 conda create -n env-konezumiaid -c conda-forge -c bioconda python=3.10 konezumiaid -y
conda activate env-konezumiaid
conda config --env --set subdir osx-64
python -c "import platform; print(platform.machine())"  # Confirm that the output is 'x86_64', not 'arm64'

ただ、最近になってBioCondaがosx-arm64に対応したので、近い将来このコードは必要なくなります🎊

To Be （理想の状態を記載。タスク完了の条件にもなる。）

• osx-arm64環境でも、conda create -n env-konezumiaid -c conda-forge -c bioconda python=3.10 konezumiaid -yでkonezumiaidがインストールできるようになる

アクション（改善のための具体的なアクションを記載）

いま現在、Bowtieをosx-arm64に対応させるように努力しています

bioconda/bioconda-recipes#49326

Bedtoolsはすでにosx-arm64環境に対応しているので、このPRが通ったら、おそらくはkonezumi-aidがosx-arm64で使えるようになると期待しています。

課題 （現状分かっている課題を記載）

None

[akikuno]

bowtieは無事に対応できました🎊

ただ、primer3-pyがosx-arm64に対応していなかったので、またPRを送りますー😇

[akikuno]

primer3-pyにPRを送りました。

さあ、うまくいくでしょうか…🙏

bioconda/bioconda-recipes#49375

[akikuno]

@aki2274

無事、konezumi-aidがosx-arm64環境でインストールできるようになりました🎊🎊🎊

以下のREADMEのNoteが必要なくなりましたので、お手すきのときにご対応お願いしますー

[akikuno]

こちら、目的を果たしたのでCloseしますー
READMEについては別のISSUEにいたします