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```{r, include = FALSE}
knitr::opts_chunk$set(collapse  = TRUE,
                      comment   = "#>",
                      fig.path  = "man/figures/",
                      out.width = "100%")
```



Roteiros de aula - LCB0217
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## Introdução

Este repositório contém os dados e roteiros de aulas práticas prática
da disciplina de Ecologia de Comunidades (LCB-0217) do curso de
Ciências Biológicas da ESALQ/USP de Piracicaba, SP, Brasil.

O objetivo aqui é introduzir de maneira prática o uso de uma linguagem
de programação (no caso o R) para a análise de dados em ecologia de
comunidades.

<br/>

## Roteiro de uso

Para poder acompanhar os roteiros você deve:

  * instalar o R em seu computador a partir [deste link](https://brieger.esalq.usp.br/CRAN/)
  * abrir uma sessão do R em seu computador a partir [deste link](https://brieger.esalq.usp.br/CRAN/)
  * descobrir em qual diretório a sua sessão está aberta usando o comando `getwd()` 
  * baixar o roteiro no mesmo diretório retornado pelo comando `getwd()` 

<br/>

## Roteiros disponíveis

Os roteiros atualmente disponíveis e os seus objetivos principais
estão listados abaixo. 

- [`manejo_dados_parcelas.R`](https://github.com/LimaRAF/LCB0217/tree/master/roteiros/manejo_dados_parcelas.R):
  * instalar programas;
  * ler arquivos de dados;
  * inspecionar e editar dados;
  * verificar grafia e nomenclatura de nomes de espécies;
  * descrever a estrutura, riqueza e diversidade da floresta (por parcela e geral);
  * visualizar os dados por tipo de ambiente;
  * salvar os resultados e figuras.

<br/>

## Organização

Este repositório esta organizado da seguinte maneira:

- [`roteiros`/`](https://github.com/LimaRAF/LCB0217/tree/master/roteiros):
para armazenar os roterios das aulas práticas;

- [`dados`/`](https://github.com/LimaRAF/LCB0217/tree/master/dados):
para armazenar os dados usados como input nos roterios e os resultados
gerados pelos roteiros. Em uma das subpastas ficam os dados brutos e
na outra os dados processados (prontos para análise);

- [`figuras`/`](https://github.com/LimaRAF/LCB0217/tree/master/figuras):
para armazenar as figuras geradas pelos roteiros;

- [`R/`](https://github.com/LimaRAF/LCB0217/tree/master/R):
para armazenar as funções desenvolvidas especialmente para o repositório;

- [`outputs/`](https://github.com/LimaRAF/LCB0217/tree/master/R):
para os resultados das análises dos dados dos roteiros.