Este es un tutorial práctico para aquellos interesados en la comunicación científica usando datos abiertos, dirigido especialmente a los periodistas y divulgadores científicos y en general a todos los curiosos de esta área, donde se junta la ciencia con el periodismo de datos para desarrollar de los cuales se nutre el periodismo científico. Para lograr generar buenas prácticas en el manejo de datos para la comunicación científica, se piesa utilizar una serie de funciones de programación estadística (en R y RStudio) y control de cambios (en Git y Github), asi analizar y reportar los resultados de nuestra investigacción.
Tiene como principal objetivo brindar un conocimiento confiable de los datos que se estén analizando e interpretando, valiéndose de una seria de procedimientos que aseguren la replicabilidad de resultados y su transparencia basado en una visión de ciencia abierta.
El principal objetivo es:
- Desaroollar un protocolo básico para el análisis inicial de la data usando R.
Los objetivos específicos son:
1. Importación de la dataset revisando la metadata.
2. Limpieza de datos de valores perdidos y atípicos.
3. Manipulación de datos para una rápida evaluación.
4. Presentación de datos en un reporte de resultados.
Es importante descargar el formato comprimible o DOWNLOAD ZIP de este repositorio y ubicarlo en la carpeta de su elección en su propia computadora, lo recomemdable sería lo descargue en ../Documentos/EpiComunicadores-main.
Una vez descargada en la carpeta /Epicomunicadores-main se podrá abrir el proyecto-R llamado OpenData-CovidPeru, al abrirse se visualizará en la sección de Files ("la zona de ficheros") donde podrá hacer click para abrir el código ubicada en la carpeta /Scripts. Una vez abierto el código, por ejemplo, se muestra la ruta de como importar la dataset de Fallecidos por Covid19.
set.seed(9)
datamorte <- read.csv("fallecidos_covid.csv", sep = ";", header = T,
encoding = "UTF-8")
Para importar tanto la base de datos de Fallecidos y Casos positivos de COVID19 será a partir de la Plataforma Nacional de Datos Abiertos. Estos datos primarios proceden de la fuente del Centro Nacional de Epidemiologia, prevención y Control de Enfermedades – MINSA, de esta plataforma se deberá descargar los siguientes datasets:
Nota: Deberás descargar los datasets directamente a la carperta principal:
/Epicomunicadores-main.
Las librerías que se utilizan son:
install.packages("pacman")
library(pacman)
pacman::p_load(
tidyverse, # data management + ggplot2 graphics
dplyr, # data management
DataExplorer, # descriptive statistics
lubridate, # manipulate dates
zoo, # alternative manipulate dates
incidence2) # epicurves of linelist data
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